重和二年(1119)，本县黄备人张应周在西干建长庆寺塔，宣和三年(1121)竣工。
宣和二年(1120)十月九日，方腊在青溪帮源起义，十二月攻克歙州。
宣和三年四月，方腊起义被镇压，改歙州为徽州。八月，迁徽州治所于新州，次年迁回原址。
宣和四年，知州卢宗原于旧州城修筑罗城，宣和五年完工。
建炎四年(1130)十一月，金兵进犯徽州，蒋杲率兵在箬岭伏击，大败金兵。
绍兴元年(1131)六月，张琪攻陷徽州。十一月，江东按抚使权邦彦派大军征讨，张琪败走。
同年，岳飞率军去洪州(今南昌)讨伐李成，途经本县，夜宿岩寺。
绍兴二年闰四月，徽州府大火，烧毁州治官舍19处，计520多间，延烧民房1500多家，3天才熄。
绍兴八年，大水，冲塌府城。
绍兴三十二年，徽州商人在境内发行“会子”，代替货币流通。
乾道四年(1168)七月，大水；次年夏，发生饥荒，人食蕨葛。
淳熙二年(1175)，罗愿编成《新安志》，共10卷。
庆元六年(1200)，府城大火，烧毁州狱官舍，延及民房800多家。
嘉定七年(1214)，大水，府城墙冲塌。
嘉定十四年，聚石立栅建渔梁坝；十七年改为石坝。
宝庆元年(1225)，知州谢塈上任，每年向朝廷进贡澄心堂纸、李廷硅墨、汪伯立笔和枣心砚。
端平元年(1234)，在城西练江上架浮桥，明弘治年间(1488--1504)改筑石桥(今河西太平桥)。
淳祐五年(1245)，建紫阳书院，理宗赵昀亲题“紫阳书院”匾额。
淳祐十年，知州谢堂于县衙之左(今歙县中学)创建县学宫。
景炎一年(1276)，元兵包围徽州，守将李铨献州城降元。
至元十四年(1277)，徽州改为徽州路，本县属徽州路。
至元二十三年春，歙、绩两县饥民造反，赶走府、县官吏。不久被许辑镇压。
至正十二年至十五年(1352--1355)，红巾军项普略、彭莹玉率义军先后四次攻占徽
城。十五年被元军击败，项普略、彭莹玉二人被杀。
至正十七年七月，朱元璋部将邓愈、胡大海攻入徽州，邓愈为枢密院判官，镇守徽
州。改徽州路为兴安府，治所不变。
同年，邓愈加筑府城城垣。
至正十八年十二月，朱元璋来徽，驻兵玉屏山，召见名儒朱升、唐仲实、姚琏、凌庆四，问以军、政方略。
至正二十七年，改兴安府为徽州府，治所不变。
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