相传，屯溪起源于三国。古时，徽州一带多处荒蛮，这里居住着一群山民，又称山越，较有名的首领，东有(今歙县)金奇，北有(今黟县)陈仆，而驻安勒山(今屯溪华山)有毛甘。各有山民一至二万户，结族而居，过着日出而作、日入而息的耕种渔牧生活。他们割据称雄，不纳王租，并抗孙吴政权，使吴军不敢入。为此，孙权派威武中郎将贺齐前来讨伐，曾屯兵于此。贺齐王平定山越，班师回朝，受到孙权出宫迎接、设宴庆贺，遂下令将贺齐在此屯兵之处，命名屯溪。

    山民平定之后，分歙县为始新、新定、黎阳(县治今黎阳镇)、休阳四县，连同原有的歙、黟共六县为新都郡，命贺齐为新都太守，这是徽州立郡之始。

    西晋太康年间(公元280~289)新都郡改新安郡，新安江由此得名。至南北朝陈文帝天嘉三年(562年)，黎阳县两度并人海宁(今休宁县海宁)县。隋文帝开皇十八年(598年)定名休宁后，黎阳属休宁县的一个乡．屯溪即是黎阳乡的一个都（古时村庄别名）。屯溪又称休宁县黎阳东乡十六都。明末清初屯溪设镇，至1949年4月30日屯溪和平解放，旋即建市。